CentOS система вроде хорошая, много положительных отзывов в Сети.
Это же просто RHEL предпоследней версии, без трейдмарок и платных обновлений. Так что плохим ему быть вроде не с чего.
Посему думаю, что проблем с дистром быть не должно.
Проблемы, как показывает практика, начнутся при сертификации - если дистр для госструктур, она окажется обязательной.
В праотеческом CentOS - будут находить баги и дыры в безопасности, их фиксить и патчить. Значит, с точки зрения компетентных органов, по наложении патчей систему нужно сертифицировать по новой. А это хлопотно и дорого.
Или - оставлять как есть, и тогда баги и дыры законсервируются, как маринованные помидоры прошлого тысячелетия...
Всё это это было неоднократно.
Разве что сам процесс освоения...если до оного дойдет.. 
А освоение что... Если бы это действительно было нужно на
государственном уровне - были бы созданы
государственные курсы повышения квалификации. Вот Олег наверняка бывал на таких неоднократно, да и мне приходилось, в другой сфере, правда.
А если нет - происходит всё, как всегда. Вон, в PCWeek'е рассказывается
душещипатешьная история , как администрация одной из областей (не важно, какой, эта история могла бы произойти и в любом другом горном районе) внедряла дистрибутив Linux, позаимствованный у службы судебных приставов. А потом ещё имела наглость требовать от них доработки и техподдержки.
Первая реакция: ребята, вы бы ещё взяли за основу дистр для французской жандармерии. А потом потребовали бы саппорта от лично главного французского жандарма (в чине, соответствующем нашему генералу армии, между прочим). Полагаю, что француз ответил бы менее невежливо
